El FODES fue creado en 1988 con el objetivo de beneficiar a los salvadoreños con obras en sus municipios, pasaron 33 años y el desarrollo nunca llegó a los municipios y comunidades.
Las administraciones anteriores del FMLN y ARENA mal utilizaron el FODES, utilizándolo para campañas políticas, crear mecanismos de plazas fantasmas y realizar pactos de corrupción con grupos criminales a cambio de votos.
Los ex alcaldes de los partidos ARENA y FMLN disfrazaban pequeñas construcciones y aumentaban su valor, las daban por «Grandes Obras» y desviaban los fondos para financiar actos de corrupción.
Con las modificaciones a la ley FODES se busca cortar con la cadena de corrupción dentro de las comunas.